肯定是有区别的,Full_Chip_Simulation_linker.prm是针对于纯仿真的,

P&E_Multilink_CyclonePro_linker.prm是用于P&E仿真器下调试耐用的,

版主，我现在是通过BDM，在P&E上进行调试的。那么我是不是只要正确设置P&E_Multilink_CyclonePro_linker.prm就好了？P&E_Multilink_CyclonePro_linker.prm和Full_Chip_Simulation_linker.prm的设置即使不一样，对我的调试是不是也没有影响？

另外，最终烧录到FLASH中的代码和上面两个prm文件的关系到底是怎样的？

烧的代码只跟"P&E_Multilink_CyclonePro_linker.prm"有关，"Full_Chip_Simulation_linker.prm"只用于纯仿真，就是说，"Full_Chip_Simulation"的时候，是不需要单片机的，直接在上位机上进行模拟，所以跟烧代码无关。