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楼主用的是de2的板子吗？你说的第一个问题意思是你把程序区设置在片外sram中，能够debug程序，但是固化运行就不可以吗？在de2中的那块sram好像确实不是很好用，的确会出现打印不对的问题，但是这也只是de2中这样，以前我自己画的板子在sram运行程序没有任何问题，我个人觉得应该是de2上的sram的硬件可能有些问题。

至于把逻辑代码和nios程序都存放在epcs中，是没有任何问题的，如果楼主用的是de2开发板，建议运行程序空间设置在sdram中。